ค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานของอุปกรณ์ EDI ได้แก่ การใช้ไฟฟ้าการใช้น้ำค่ายาและค่าเสื่อมราคาของอุปกรณ์การลดต้นทุนการใช้กรดและด่างการบำบัดน้ำเสียการบำบัดน้ำเสียและการปล่อยน้ำเสีย
ในการใช้พลังงาน, อุปกรณ์ EDI เกี่ยวกับน้ำ 0.5kWh / t, เตียงผสมเกี่ยวกับน้ำ 0.35kWh / t, ค่าใช้จ่ายของการผลิตไฟฟ้าในโรงงานค่อนข้างประหยัดสามารถใช้ราคาของกระแสไฟฟ้าในการคำนวณโรงงาน
ในส่วนของการใช้น้ำอุปกรณ์ EDI ผลิตน้ำได้สูงโดยไม่ต้องรีไซเคิลดังนั้นต้นทุนการดำเนินงานในพื้นที่นี้จึงต่ำกว่าเตียงผสม
มีความแตกต่างกันเล็กน้อยระหว่างค่าใช้จ่ายของร้านขายยาและค่าเสื่อมราคาของอุปกรณ์
โดยรวมแล้วในค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานหน่วย EDI มีต้นทุนการดำเนินงานที่ประมาณ 2.4 หยวนซึ่งเป็นอัตราการผสมน้ำเตียงแบบธรรมดาที่ใช้ในการดำเนินงานประมาณ 2.7 หยวนสูงกว่าอุปกรณ์ EDI ดังนั้นค่าใช้จ่ายของอุปกรณ์ EDI ที่มีการลงทุนหลายรายสามารถกู้คืนได้ภายในไม่กี่ปี