การทำความสะอาดของเมมเบรนโดยทั่วไปจะแบ่งออกเป็นสองประเภทของการทำความสะอาดทางกายภาพและการทำความสะอาดสารเคมีและความถี่สูงกว่าการทำความสะอาดสารเคมีมากขึ้นความเสียหายที่เกิดกับเมมเบรนอย่างจริงจังได้รับผลกระทบต่อชีวิตของระบบเมมเบรน
ความถี่ในการทำความสะอาดเมมเบรนมีความสัมพันธ์กับระดับของการปรับปรุงมาตรการก่อนการบำบัด การเตรียมผิวที่สมบูรณ์แบบยิ่งขึ้นระยะเวลาการทำความสะอาดที่ยาวขึ้น อีกวิธีหนึ่งคือการทำความสะอาดก่อนการทำความสะอาดง่ายขึ้น การทำความสะอาดเมมเบรนโดยทั่วไปจะตามด้วยการลดอัตราส่วนของการไหลของน้ำจืดที่ลดลง 10% เมื่อเทียบกับอัตราการไหลของ 200 ชั่วโมงแรกและ 10 ถึง 20% ของความดันที่แตกต่างกันที่สังเกตได้ พยายามใช้มาตรการให้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้เมื่ออัตราการเทน้ำลดลง การป้องกันที่ได้รับการป้องกันอย่างสม่ำเสมอคือการป้องกันไม่เพียงพอที่จะป้องกันระบบ Reverse Osmosis
ระบบทำความสะอาดทางเคมีมักประกอบด้วยถังผสมสารเคมีและเครื่องผสมอาหารเครื่องผสมเครื่องทำความร้อนและอื่น ๆ ตามประสบการณ์การดำเนินงานในการตัดสินใจ (ตามการอ่านค่าความดันของอุปกรณ์แต่ละคอลัมน์การอ่านและการวิ่งโค้งเวลาหรือจากการผลิตน้ำคุณภาพน้ำจืดและความดันลดลงเมมเบรน ฯลฯ )
สารทำความสะอาดทางเคมีและวิธีการที่ใช้ในการพิจารณาตามแหล่งมลพิษ ตารางต่อไปนี้สำหรับการอ้างอิง แต่ควรให้ความสำคัญกับและการใช้ประสบการณ์ของหน่วย เพื่อให้แน่ใจว่ามีผลในการทำความสะอาดสารเคมีก่อนล้าง ล้างออกก่อนที่ขั้นตอนแรกและจากนั้น 2-3 ครั้งการไหลตามปกติของน้ำล้างพังผืดโดยบทบาทของของเหลวกวนสิ่งสกปรกจากพื้นผิวเมมเบรนจากเยื่อหุ้มปอกและล้างออกไป